Fishrine

“208实验室里充满了微波炉、冰箱、平底锅等，208总是虚掩着的门里面不时飘来各种味道：白天是豆瓣酱，深夜是煎蛋面。在208度过的两个打盹之夜都是非常令人难忘的……”  

——题记

 

 Melamine

虽然没有发生空压机爆炸之类惊天动地的事情，但那两个夜晚除了睡觉的时间，还是有很多零散的碎片，随意散落在记忆里……直到三聚氰胺的出现...

-----UPDATE 2008-09-22----------

补充1：前天逛家乐福，家乐福也很识时务，把大约500g包装的多美滋奶粉打特价卖51.00元，于是我就有幸亲眼见识到进口配方奶粉是如何被抢购的场面了

补充2：林老师今天上课提的问题，我算了一下melamine里面N含量是66.67%，凯氏定氮的话，如果蛋白质样品里面N含量测出来超过16%，样品的总蛋白质百分含量就超过100%了……

 

发酵实验室虽然没有10万级、30万级洁净区那样的要求，也没有P4实验室那么大的毒性，但每当实验的季节来临，我们不是像食品系的同学一样穿一身白衣，就可以飘去烤蛋糕做面包烘泡芙；也不像水利水电的同学那样坚若磐石，静静坐着对着电脑进行各种CAD+CFD就可以的。对微生物虽然只是进行各种入门级的蹂躏，工欲善其事，装备还是要清点一下的。

1、乳胶手套

有伤口时防感染，没伤口时防腐蚀。

我永远都会把清洁液和洗手液区分得很清楚的，不然买护手霜的钱就白花了。

2、棉手套

天气热，但160度的烘箱更热，所以双手都要戴很厚的棉手套（才能避免我手指被烫到的悲剧第三次发生）。

3、护目镜

UVEX的某款medium impact（中等抗冲撞，从A320工程师那里捡来的装备）。关于护目镜，书上有提醒，眼科医生也有提醒。后天要做紫外诱变，但我在它说明上没找到是否防紫外线的描述，对这个装备的性能不太有把握～

暂时列出这么多，边做实验边想再补充。 

当时从图书馆深处把布满灰尘的introduction to Rheology翻开开始读的时候，很有一种“茹毛饮血”的感觉……也不知道是技术差还是校园网烂，我没有穿透各种屏障搜索到相关词汇完善的翻译，看PAPER看得很辛苦。反正如果有英国的英语和法国的家乐福一样被抵制的那一天。

Glossary of Rheology[流变学词汇](Sourced: An Introduction to Rheology) 

Anti-thixotropy[反触变性]

An increase of the apparent viscosity under constant sheer stress/rate followed by a gradual recovery when the stress or shear rate is removed. The effect is time-dependent. 

Apparent viscosity[表观粘度]

The shear stress...

(未完待续) 

composed @ 2008-01-15 00:26:12 虽然零摄氏度刮风的雨夹雪天气，并没有想象中那么糟。但跟老师闲聊，突然被她问道关于胶原的问题时，的确被冻在了那里，三秒。 问：如果溶液中的胶原分子交联，是发生在三螺旋外的还是螺旋内部？可不可能发生在内部？ 我：（开始GOOGLE：什么是分子交联？->什么是三螺旋?->三螺旋结构？）……不会，因为胶原分子内部，原子是紧密堆积的。 松了一口气之后，我才发现collagen这个词语，真的在我头脑中冷却了。原本应该ms级的反应，居然用了三秒。但问题是，我并不知道原子内部紧密堆积这个结论是如何得来的。

现在我才发现，collagen及其周边词汇，在我这里，都结冰了。

上次翻译了一部分就偷懒没有翻译了，现在要交给老师看了（虽然我猜她也不会仔细看我翻译的内容），拖到现在终于还是把它翻译完了。

 

胶原蛋白（查看原文）

April 2000, Molecule of the month

by David S. Goodsell

Translated by Fishrine

|接上篇翻译：PDB - April 2000 Collagen（胶原蛋白） - （一）体内含量最大的蛋白质|

探索结构

 

 

一种特殊的氨基酸序列使得紧密的胶原三螺旋相当的稳固。每三个氨基酸中就有一个是甘氨酸，剩余的很多都是脯氨酸和羟脯氨酸。图中所示是一种经典的三螺旋结构，可以查看PDB文件1cag。可以看出，甘氨酸在螺旋中形成了一个微小的弯折，同时可以看到脯氨酸和羟脯氨酸使得长链绕着螺旋光滑的弯回来。在这种结构中，研究人员用丙氨酸取代了甘氨酸的位点后，这条链就挤向了相邻的链。

 

这条胶原螺旋是人体胶原中的一段，可以在PDB文件1bkv中看到。可以注意到上半段螺旋是非常整齐一致的。上半段序列是由谷氨酸和脯氨酸按照理想状态搭配在一起形成的混合体，而下方的螺旋则不那么规则，因为均匀分布的谷氨酸只见插入了许多不同的氨基酸。

 

长绳和梯子

我们把胶原分成了很多不同的类别，他们形成的带状和层状的结构，在成熟动物体内起到支持的作用，并在生长中支持细胞运动。所有特定的三螺旋长链都有不同的末端。最简单的基本上就是一条长链带一个粗糙末端。这些I型胶原就像绳子中的纤维一样相互作用形成原胶原纤维。原胶原纤维交错在我们几乎每一个细胞内的空间里。

插图展示的是基底膜的结构，基底膜形成的粗糙表面起着支持皮肤及众多器官的作用。一种特殊的胶原 - IV型胶原 - 形成了这种膜的基本结构。IV型胶原一端有一个球形的“头”，另一端有一条“尾”。“头”与“头”相对着紧紧结合在一起，4条胶原分子通过它们的尾部结合在一起，形成一个X形的结。这两种相互作用，延伸出了IV型胶原的网状结构。另外两种分子 - 十字形的层粘连蛋白（蓝绿色）以及长条的蛋白多糖（绿色） - 填充在间隙空间里，形成了致密层。

 

 

至今没发现哪个品牌的护肤品不包含保湿类产品。皮肤保湿的重要性，美女主持们在节目中也不时请专家达人美容大王美丽教主等等来诲人不倦（最后顺带推荐一下遮住品牌名字但包装轮廓很清晰的化妆品）。But why? 对于身心健康这类严肃问题，我们一定要认真对待，并尝试着进行科学的分析。其实我认为这比认她们手上晃来晃去的包装还要容易一些...

运用点生化或者蛋白质工程学的东西，再结合一下化工原理，我们可以从两个方面入手简单分析。

冬季保湿 - 蛋白质

冬季温度降低，空气湿度就会下降，环境变得干燥（环境干燥最明显的标志就是静电很容易产生），皮肤也会干燥，紧接着就会脱皮（不是每个人每次洗完澡都坚持用Vaseline之 类从头到脚抹一遍吧）。脱皮是因为表面角质层皮“年久失修”无法承受这种失水后的干燥，于是就脱落下来了。因而要解决这个问题就应该解决角质层“年久失 修”的老化问题。老化问题怎么解决？很简单，跟杀毒软件一样，常更新嘛。皮肤要更新，所以又牵扯到了新陈代谢的问题。当然，有人又要说皮肤老化是氧化的问 题，我也没说不是。不然嫦娥姐姐去了月亮，干嘛还带个吴刚去砍树呢？还不就因为万恶的桂树会不断的把二氧化碳变成氧气。

还有一点就是，如果你的皮肤会长点痘痘的话，你也会发现，冬季里痘痘的红肿消失得也要慢一些...

反正都是作业要用的，先翻译，完了还要写。PDB上每个月都有科普性质文章，比较有教育意义。

胶原蛋白（查看原文）

April 2000, Molecule of the month

by David S. Goodsell

Translated by Fishrine

体内含量最大的蛋白质
你体内的蛋白质有四分之一都是胶原。 胶原是一种主要的结构蛋白，由它形成的分子链强化了对皮肤及内脏器官起支持作用的肌腱和大量的弹性膜。骨骼和牙齿就是由聚合了矿物晶体的胶原构成的。胶原构成了我们身体结构，同时也对柔软的组织起到保护和支持的作用，并使之与骨骼相连。但如果不看它在体内的关键性作用的话，胶原其实是一种相对简单的蛋白质。


胶原三螺旋
胶原由三条链相互紧密缠绕形成的三螺旋构成。插图只显示了整个分子中的一小段——每条链由超过1400个氨基酸残基构成，图中只显示了大约20个氨基酸残基。三种氨基酸构成的重复序列形成了这种稳定结构。每隔两个氨基酸就会有一个是甘氨酸——一种与螺旋内部结构完美搭配的小分子氨基酸。剩余的很多位置都由两种未知氨基酸占据：脯氨酸，以及它经过修饰的版本——羟脯氨酸。而脯氨酸并不那么普通，它在胶原多肽链中形成很不匹配典型球蛋白结构的扭转。 而正因为如此（接下来你会看到），这才是一种结构蛋白所需的结构。


维生素 C
羟脯氨酸，一种对胶原结构稳定性极其重要的氨基酸，是由普通的脯氨酸在胶原链形成后经过化学修饰而来的。而这一修饰反应需要维生素C辅助参与加氧过程。而我们体内又不能合成维生素C，如果我们在饮食中无法得到足够的维生素C的话，结果就很惨了。维生素C缺乏会延缓羟脯氨酸的形成，同时阻断新的胶原合成，最终导致坏血病。掉牙齿以及瘀伤等坏血病的征兆都是由于缺乏胶原去修复日常活动对身体的磨损引起的。


生鲜货架上的胶原
来源于家畜的胶原是烹饪中很常见的原料。跟大多数蛋白质一样，胶原受热后它的结构也会消失。三螺旋解旋并伸展开，三条链也随之分离。随后，这种变性后的杂乱多肽链冷却下来，就会像海绵一样吸收周围的水分，最终成为明胶。

晚上吃过饭，在微生物实验室大家一边做事一边聊天，捏着棉塞，裹着培养皿，更换新的接种针，消毒瓶瓶罐罐和试管，准备好下周实验要的的东西，不知不觉就到 了9点半。虽然一次包裹10个培养皿还有点困难，单手拿五根试管一次性接种还显得很虚幻，不过我看一起的这几位同学都还很有希望的，可尝试朝高手级别发 展。

回来上网休闲，顺便发现明日黄花一条：

北京时间10月8日下午5点30分，2007年诺贝尔生理学或医学奖揭晓，美国犹他大学Eccles 人类遗传学研究所科学家Mario R. Capecchi 、美国北卡罗来纳州大学教会山分校医学院教授Oliver Smithies 与英国科学家卡迪夫大学卡迪夫生命科学学院Martin J. Evans因干细胞研究获得此奖项。

今年的三位诺贝尔奖获得者是由于在胚胎干细胞和哺乳动物的DNA重组方面的开创性成绩而获奖。由于他们的发现，产生了一种名别“小鼠中的基因打靶”的技术。这项技术极其有用，目前已经被广泛应用在几乎所有生物医学领域——从基础研究到新疗法的研制。
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