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2007-11-17
翻译:PDB - April 2000 Collagen(胶原蛋白) - (二)探索结构 - [专业相关]
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http://fishrine.blogbus.com/logs/10843281.html

上次翻译了一部分就偷懒没有翻译了,现在要交给老师看了(虽然我猜她也不会仔细看我翻译的内容),拖到现在终于还是把它翻译完了。
胶原蛋白(查看原文)
April 2000, Molecule of the month
by David S. Goodsell
Translated by Fishrine
|接上篇翻译:PDB - April 2000 Collagen(胶原蛋白) - (一)体内含量最大的蛋白质|
探索结构

一种特殊的氨基酸序列使得紧密的胶原三螺旋相当的稳固。每三个氨基酸中就有一个是甘氨酸,剩余的很多都是脯氨酸和羟脯氨酸。图中所示是一种经典的三螺旋结构,可以查看PDB文件1cag。可以看出,甘氨酸在螺旋中形成了一个微小的弯折,同时可以看到脯氨酸和羟脯氨酸使得长链绕着螺旋光滑的弯回来。在这种结构中,研究人员用丙氨酸取代了甘氨酸的位点后,这条链就挤向了相邻的链。
这条胶原螺旋是人体胶原中的一段,可以在PDB文件1bkv中看到。可以注意到上半段螺旋是非常整齐一致的。上半段序列是由谷氨酸和脯氨酸按照理想状态搭配在一起形成的混合体,而下方的螺旋则不那么规则,因为均匀分布的谷氨酸只见插入了许多不同的氨基酸。
长绳和梯子
我们把胶原分成了很多不同的类别,他们形成的带状和层状的结构,在成熟动物体内起到支持的作用,并在生长中支持细胞运动。所有特定的三螺旋长链都有不同的末端。最简单的基本上就是一条长链带一个粗糙末端。这些I型胶原就像绳子中的纤维一样相互作用形成原胶原纤维。原胶原纤维交错在我们几乎每一个细胞内的空间里。
插图展示的是基底膜的结构,基底膜形成的粗糙表面起着支持皮肤及众多器官的作用。一种特殊的胶原 - IV型胶原 - 形成了这种膜的基本结构。IV型胶原一端有一个球形的“头”,另一端有一条“尾”。“头”与“头”相对着紧紧结合在一起,4条胶原分子通过它们的尾部结合在一起,形成一个X形的结。这两种相互作用,延伸出了IV型胶原的网状结构。另外两种分子 - 十字形的层粘连蛋白(蓝绿色)以及长条的蛋白多糖(绿色) - 填充在间隙空间里,形成了致密层。

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